أعلن وزير الأوقاف، الدكتور محمد مختار جمعة، قرارا بإعادة فتح مسجد الحسين للصلاة جزئيا في النصف الغربي من المسجد وهو الجزء البعيد تماما عن الاتصال بالمقام حفاظا على الجميع، جاء ذلك بناء على تقرير اللجنة التي تم تشكليها لمعاينة الإجراءات التي انخذتها مديرية أوقاف القاهرة للحفاظ على سلامة المصلين.
وقامت مديرية الأوقاف بالقاهرة بتعقيم المسجد كاملا، وتم عمل حرم آمن يعزل مكان الصلاة عزلا تاما عن المقام، ونظرا لمكانة المسجد الكبيرة في نفوس المصريين جميعا تم الإقرار بإعادة فتح المسجد للصلاة جزئيا في النصف الغربي من المسجد وهو الجزء البعيد تماما عن الاتصال بالمقام حفاظا على الجميع، على أن تكون إعادة الفتح الجزئي فجر الأربعاء القادم الموافق 8 / 7 / 2020.
يذكر أن قام بعض مرتادي المسجد عقب إحدى الصلوات بمخالفة تعليمات الأوقاف ومحاولتهم الاستعاضة عن زيارة المقام بالوقوف على الحائط الخارجي له، مما دعا وزارة الأوقاف لإغلاق المسجد لعدم الالتزام بالإجراءات الاحترازية المطلوبة التي اشترطتها وزارة الأوقاف بالتعاون مع وزارة الصحة لفتح المساجد بناء على قرار رئيس الوزراء برجوع الحياة إلى طبيعتها وتخفيف الإجراءات الصارمة التي اتذتها الحكومة بسبب جائحة كورونا.